داروخانه کلینیک ویژه شهید مطهری شیراز یکی از  شعبه های  داروخانه های آموزشی دانشکده داروسازی است که  همه روزه بجز پنج شنبه ها و روزهای تعطیل ، صبحها از ساعات ۸ تا ۱۲ و بعدار ظهر ها از ساعت ۱۴تا ۲۱:۳۰ آماده خدمت رسانی به مراجعین ارجمند است .این داروخانه دارای لابراتواری است که در آن ، داروهای ترکیبی شامل پماد، کرم، لوسیون، محلولهای موضعی، محلولهای خوراکی و … با بهترین کیفیت و زیر نظر اعضای هیات علمی دانشکده داروسازی تهیه، بسته بندی و در اسرع وقت تحویل بیمار می شود به علاوه ، فراورده هایی همچون کپسول و یا قرص نیز برحسب نیاز و سفارش پزشکان محترم ، فرموله و ساخته شده، در اختیار مراجعین ارجمند قرار داده می شود . همچنین همکاری این واحد با پزشکان محترم در طرح های تحقیقاتی ، از دیگر مواردی است که این داروخانه برعهده گرفته است .
برنامه کار واحد
همه روزه بجز روزه های پنج شنبه و تعطیلات .
روندکار پذیرش .

       پس از ورود بیمار به داروخانه نسخه دارویی وی توسط یکی از تکنسین های داروخانه بررسی و در نوبت نسخه پیچی قرار می گیرد. دارو توسط دیگر تکنسین دارویی آماده و جهت قیمت گذاری تحویل تکنسین سـوم می گردد و نهایتاً پس از درج قیمت، دارو به قسمت پیشخوان می رسد که پس از رؤیت اینترن داروسازی و یا عضو هیات علمی و مطابقت آن با نسخه پزشک ، با فراخــوانده شدن بیمار ، قبض پرداخت وجه ، در اختیار وی قرار خواهد گرفت ؛ بیمار ، پس از پرداخت وجه دارو به صندوق داروخانه و ممهور شدن قبض به مهر ، فرد دوباره به پیشخوان بر می گردد و مسئول فنی (اینترن داروسازی و یا عضو هیئت علمی ) توضیحات لازم در مورد دارو را به وی ارائه می دهد و داروهای فرد به همراه دفترچه درمانی (و در صورت نسخه آزاد اصل نسخه پزشک) تحویل بیمار می گردد بعلاوه مبلغ دریافتی از بیمار نیز روی برگ رونوشت دفترچه یا اصل نسخه آزاد درج و به مهر داروخانه و مسئول فنی مربوطه ممهور می گردد.